Ihmeotukset ja niiden olinpaikat on aivan uusi seikkailu, joka vie yleisön takaisin J. K. Rowlingin velhomaailmaan. Neljä viimeistä Harry Potter -elokuvaa luotsanneen David Yatesin ohjauksen keskeisessä roolissa nähdään Oscar-voittaja Eddie Redmayne (Kaiken teoria), joka esittää velhomaailmassa toimivaa taikazoologia, Lisko Scamanderia. Elokuvan tapahtumat sijoittuvat vuoteen 1926, jolloin Lisko Scamander on juuri saanut päätökseen maailmanlaajuisen tutkimusmatkansa löytääkseen ja dokumentoidakseen erikoislaatuisen joukon taikaolentoja. Ennen kotiinpaluutaan Lisko tekee välipysähdyksen New Yorkissa. Lyhyeksi suunniteltu pysähdys kuitenkin pitkittyy, kun kuvioihin astuvat Jacob-niminen ei-taik (amerikkalainen nimitys jästille), kadonnut taikasalkku, sekä Liskon karanneet ihmeotukset, jotka tapaavat aiheuttaa harmia niin velhoille kuin ei-taikeille.